如何在ms中手动建模（建模之MS一功能介绍）

MS，全称Materials Studio，是少有的能在win系统上操作的计算模拟软件（常见的除此之外仅有Gaussian了）。并且与商业软件Gaussian一样，具有集模型构建、计算及后处理于一体的商业软件。

业内人士一致认为，MS全程仅用鼠标就可完成全部计算过程，入门的门槛太低，且由于昂贵的费用，因此接受度相比于其他软件低得多。计算领域某高被引学者认为MS不宜进行量化计算，容易被审稿人批，且价格昂贵，附上文章部分内容如下：

尽管MS不宜作为计算的软件，但是MS在模型的构建以及快速的力场优化方面还是非常好用的，小王就屡试不爽。

好了，接下来步入正题。

今天对无边界的石墨烯的构建进行介绍！！！

首先需要准备好MS软件，本公众号为大家准备了MS软件的资源，期待的Materials Studio安装包及教程来了！对于安装也是如同所有win安装软件一样，so easy。

那么打开MS进入界面，首先创建一个项目，小王命名为1.stp，右击如下图红圈框起来的“1”，接着选择New---3D Atomistic Document，即可创建绘图界面。

最常用的快捷界面上的选项如下已经圈好的①~③。①主要是用于框选结构、平移、旋转、放置中央等；②用于绘制分子结构，以及替换原子、加氢、对称等；③用于精准移动旋转等。

接下来小王以手动构建的方式以及导入的方式进行演示。

1.手动构建

在上面②中

里选择六元环（6 Member），然后按住alt在绘图界面上绘制即可得到一个苯环（若不按alt得到的是六元环）如下。

在苯环的边缘继续使用如上操作，即可得到石墨烯结构。

此时如需球键模式等，可在此界面右击选择“Display Style”出现如下选项，可尝试选择框选栏内不同选项得到不同的结构显示模式。

石墨烯如需补氢，则可通过自动加氢，即选择③中的实现，最后建议自己建模型时选择

选项，得到初始的模型。

ps：鼠标右键可拖动结构；滑轮滑动可放大缩小结构；按住滑轮可进行拖移。

2.导入模型

导入模型在小分子构建可能没什么大的用处，但对于大分子构建能省时省力。

在File---Import里打开如下窗口，若不出现如下内容，则可手动进入MS项目存放位置，也可找到该文件夹。

在子目录Structures里就有已分类的各种结构，我们可以在ceramics文件夹里选择graphite.msi得到下图。注：不知道分在哪一类时，也可通过右上角搜索英文名，在子目录中找到文件。

拖动鼠标右键可以发现，我们打开了一个石墨烯晶胞，可以通过如上介绍，从display中显示为球键模型。

随后在菜单栏选择Build---Symmetry---Supercell，如下图：

A、B、C分别为在x、y、z方向上扩大多少倍，切记只能输入整数倍。注：扩胞之后可通过撤销返回，亦可先用右击选择Display Style---Lattice选项，从下图框选栏里扩大倍数，可以看到扩大后的样子，但实质上没有扩胞，依然可在选项内修改回来。

以x、y方向扩大四倍为例得到如下。

选择①中的框选一层，复制然后粘贴到新建的绘图界面即可得到非周期性石墨烯结构。

自行框选原子后选择多余的原子，即可得到和自己建出来同样的结构！！！

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