seer数据库是怎么检测的（SEER里的那些特殊变量）

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经常收到朋友提问，SEER里面有基因数据吗？有肿瘤标志物吗？有免疫组化吗？

答案是有的，不过数量有限，而且不是很明显，新手确实不好找到。

如果能灵活应用，就可以为自己的研究增色不少

先来安利几篇SEER数据库，含有这些“特殊变量”的文章

① 研究直肠癌的文章，纳入了癌胚抗原CEA

② 研究肝癌的文章，纳入甲胎蛋白 AFP

③研究口腔舌癌的文章，纳入神经侵犯 perineural invasion

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SEER数据库的特殊变量在哪里？

就是我们下载数据的时候，出现的这些SSF1，SSF2。。。SSF20等变量

但是我们要知道分别代指什么

SSF：site specific factor

SEER Stat 软件里位置如下，直接下载即可

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SSF替换

参考 SSFs.Released.v205.Nov2016.xls

说明：并非每一种癌症都有可用SSF等指标

而且，同一种SSF在不同癌种里面，对应内容也不一样

比如SSF1，在乳腺癌里代表ER状态，在食管胃结合部癌，则代表区域淋巴结检查结果

通过该文件，能够得到SSF对应指标名称，但是对于后续数据整理，具体数值变换没有帮助

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这时候需要使用 CS_Coding_Instructions_V0205.exe 这一软件

比如这里，000代表未做检查，010代表ER( )，020代表ER(-)

做乳腺癌的同学，能够把ER, PR, HER2指标纳入进去，文章一定增色不少

文示例文献：

1.Tan Y, Fu D, Li D, et al. Predictors and Risk Factors of Pathologic Complete Response Following Neoadjuvant Chemoradiotherapy for Rectal Cancer: A Population-Based Analysis. Front Oncol. 2019;9:497. Published 2019 Jun 13. doi:10.3389/fonc.2019.00497

2.Berger NG, Tanious MN, Hammad AY, et al. External radiation or ablation for solitary hepatocellular carcinoma: A survival analysis of the SEER database. J Surg Oncol. 2017;116(3):307–312. doi:10.1002/jso.24661

3.Goodman M, Liu L, Ward K, et al. Invasion characteristics of oral tongue cancer: frequency of reporting and effect on survival in a population-based study. Cancer. 2009;115(17):4010–4020. doi:10.1002/cncr.24459

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