黑客帝国4超深度解析 黑客帝国4剧情的几个重要疑问
老实说这部电影本身有很大的问题，导演拉娜·沃卓斯基似乎并没有准备好，整部影片像是临时拼凑的草台班子唱戏，想到一出是一出；发行方居然非常自信地把档期放在圣诞节，试图跟大热门《蜘蛛侠3》扳手腕，结果当然可想而知。
更重要的是，原本《黑客帝国》系列标志性的动作戏完全消失不见，武术打斗像是公园里晨练大爷的太极推手。当然，以基努李维斯这个年纪还要求他像20多年前那样上蹿下跳确实有些强人所难，所以可能是出于降低动作戏难度的考虑，才为尼欧设计了突兀的能量护盾技能，看得人一脸尴尬。
尽管如此，毕竟还是黑客帝国系列的正统续作，剧情也的确有很多值得探讨的地方，所以笔者觉得还是有必要做一期解答部分粉丝的疑问。
剧透预警！
关于墨菲斯的代码
电影故事发生在三部曲完结的60年之后，真实世界里的墨菲斯已经死亡，所以电影中出现的年轻版墨菲斯实际上是托马斯·安德森在自己游戏里编写的一段代码。
这个所谓的游戏就是一个在当前“母体”之中模拟现实的二层“矩阵”（类似于《盗梦空间》里的二层梦境）。当“Bugs”发现了这个不断重复旧代码的下层矩阵之后（模拟当年崔尼蒂被“特工”追捕的桥段），意外在其中找到了隐藏在“史密斯特工”代码下的墨菲斯的“模态代码”，所以她赶在代码被托马斯·安德森的合伙人（上层“母体”中真正的史密斯特工）清除之前，将其解救出来。
当然，由于墨菲斯只是一段模态代码（用于模拟人类的性格和记忆），所以他只能存在于“母体”世界，在实体世界需要通过一种塑形粒子成像才能与人交流。
在尼欧发现自己的“母体”游戏遭到入侵之后，终端屏幕上可以看到一串报错信息。
error:missing file 'morph.bld.exe'
进一步证实墨菲斯是尼欧利用梦境中的记忆编写的一段模态代码（Modal），只不过它在游戏里被封装在“史密斯特工”的代码里，可以看作是尼欧用来探索自己“梦境”的情感锚点。
托马斯·安德森在剧中有着不同的容貌，比如在“Bugs”还是一名洗窗工人的时候，她看到的托马斯是个光头的形象（正打算自杀）。
等到“Bugs”向托马斯介绍这个世界的真相时，他在镜子里的形象成了一名白发老者。
对了，镜中男子的扮演者是演员史蒂芬·罗伊，也就是崔尼蒂的扮演者凯莉-安·摩丝现实当中的丈夫。
这些不同的形象代表了尼欧在“母体”当中不同的D.S.I（数字化自我影像），和上一代“母体”的R.S.I（残留自我影响）有所不同，D.S.I可以被篡改或者复制，以此来达到限制尼欧自我意识的目的。
另外，托马斯和“蒂芙尼”在咖啡店见面的时候，她在咖啡桌上的倒影是一名金发女子，表明这个“母体”至少为他们两人准备了不同的D.S.I，为的就是让二者保持“不算太远的距离”，但是又无法认出彼此。
虽然三部曲的结尾，尼欧与机器城达成停火协议，将人类圣城从“哨兵”机器人的进攻下拯救出来，不过锡安还是在之后的机器城内战中遭到摧毁（墨菲斯可能是在那个时候牺牲）。
幸存的人类在一些叛逃机器的帮助下，建立了新的圣城艾奥。古希腊传说中，艾奥是宙斯的情妇，但是被嫉妒的天后赫拉变成了一头母牛。不过这个神话故事似乎和人类当时的处境没有什么关联，另一种解释是艾奥“IO”取自先前圣城锡安“ZION”的中间两个字母，代表这个城市脱胎自锡安，但没有起点也没有终点。
这可能是本片上映以后最具争议的话题，导演拉娜·沃卓斯基对此也没有进一步的解释，留下一堆懵逼的粉丝众说纷纭。所以目前网络上什么样的说法都有，比较令人信服的有两个：
1.崔尼蒂本来就是“the one”。
实际上在三部曲里，“架构师”（Architect）就已经对尼欧说过，“母体”世界里的救世主是事先安排好的，只是机器给人类提供的“安慰剂”。而尼欧之所以能在最后激发出真正的力量摧毁机器城周围的“哨兵机器人”，恰恰是因为他违反常规，选择拯救崔尼蒂而不是全人类。所以从这个意义上来讲，崔尼蒂才是真正的救世主。
2.崔尼蒂的能力来自尼欧
崔尼蒂在《黑客帝国2》里被特工射杀之后，尼欧用手伸入她的体内取出了子弹并按摩她的心脏，这个镜头被认为是尼欧的“异常代码”与崔尼蒂相融合的结果，让崔尼蒂成为和尼欧一样的救世主。
只不过崔尼蒂后来死在前往机器城的“拉哥斯号”飞船上，没能得及释放她的潜力。
为什么史密斯特工最后选择帮助尼欧本作最大的反派是安德森的心理治疗师，也就是自称取代了“构架师”的“新母体”创建者——“分析师”。
关于“分析师”复活尼欧和崔尼蒂的动机还比较容易理解。他的研究发现只要抑制二人的记忆，让他们彼此靠近但又保持适当距离，能够让“母体”更有效地运作生产更多的电力，还能降低系统崩溃的风险。
但是这并不能解释为什么“分析师”要把“史密斯特工”的代码加入“母体”，毕竟正是因为他才造成了上一代“母体”的崩溃。
有些理论认为是“Bugs”将墨菲斯的“模态代码”解救出来之后，伪装的特工代码也被一并释放出来，然后再占据了尼欧合伙人的身体成为史密斯特工。问题是，“二层母体”只是尼欧自己编写的，史密斯的代码不可能在“母体”当中有能力与之抗衡，更不用说最后他可以匹敌“分析师”的子弹时间。
其实在三部曲的时候，先知就对尼欧说过，史密斯和他实际上是一体的。是系统算法为了平衡尼欧带来的异常状况而自动衍生出来的另一段“异常代码”，他们二者可以看作硬币的阴阳两面，一方的存在也必然导致另一方的存在，反之亦然。所以“分析师”在重置“母体”并且导入尼欧和崔尼蒂的源代码之后，就必然导致了史密斯的重生。
随后史密斯在“分析师”的控制之下监视尼欧（要求他定期参加心理辅导），但是随着尼欧的觉醒，史密斯的“特工”记忆也逐渐苏醒。他最开始将尼欧视作自己摆脱“分析师”控制的障碍，和“法国佬”梅罗文嘉联手袭击了尼欧一伙人。
但是史密斯很快意识到自己和尼欧之间的关系，而且在这个新的“母体”世界，由于同时有尼欧和崔尼蒂这两个“异常代码”存在，史密斯的代码也会更加强大，以至于能够同“分析师”控制的子弹时间较量。这也是为什么史密斯愿意在最后关头帮助尼欧击败“分析师”，因为这最符合他的利益。
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