家禽动物的叫声词汇(JIA家禽动物遗传主题文章)

本期精选JIA 2020-2021年出版的家禽动物遗传研究相关文章,所有文章在ScienceDirect平台开放获取,点击文章题目可查看全文,下面我们就来说一说关于家禽动物的叫声词汇?我们一起去了解并探讨一下这个问题吧!

家禽动物的叫声词汇(JIA家禽动物遗传主题文章)

家禽动物的叫声词汇

本期精选JIA 2020-2021年出版的家禽动物遗传研究相关文章,所有文章在ScienceDirect平台开放获取,点击文章题目可查看全文。

Follicle-stimulating hormone is expressed in ovarian follicles of chickens and promotes ovarian granulosa cell proliferation

卵泡刺激素在鸡卵泡中表达且促进卵巢颗粒细胞增殖

本研究证实FSH在鸡卵泡不同时期均有表达,颗粒细胞中FSHβ mRNA表达信号强于卵母细胞(P<0.05)。卵巢中FSHβ 369 bp的编码序列与垂体中FSHβ的编码序列完全相同。体外实验表明卵巢具有FSH分泌功能。此外,卵泡中FSHβ mRNA表达显著上调(P<0.05),且随着卵泡发育,FSHβ mRNA表达水平显著高于垂体(P<0.05),约为垂体的2~23倍。siRNA处理后卵巢颗粒细胞数量明显减少(P<0.05),说明卵巢FSH可促进颗粒细胞增殖。这一观点得到了细胞周期分析和CCND2CCNE2表达的支持。进一步研究表明,经FSHβ siRNA处理的颗粒细胞数与外源性FSH处理的颗粒细胞数无显著差异(P>0.05),而未经FSHβ siRNA转染的颗粒细胞数明显高于外源性FSH处理的颗粒细胞数(P<0.05)。提示外源性FSH对卵巢颗粒细胞的增殖作用依赖于内源性FSH。本研究表明FSH基因在鸡卵泡中表达,促进卵巢颗粒细胞增殖。本研究可以丰富HPG轴的理论。

Cite this article:

BI Yu-lin, YANG Shu-yan, WANG Hai-yan, CHANG Guo-bin, CHEN Guo-hong. 2021. Follicle-stimulating hormone is expressed in ovarian follicles of chickens and promotes ovarian granulosa cell proliferation. Journal of Integrative Agriculture, 20(10): 2749–2757.

Integration of association and computational methods reveals functional variants of LEPR gene for abdominal fat content in chickens

整合关联分析和电子计算分析揭示LEPR基因影响鸡腹部脂肪含量的功能变异

本研究的目的是以东北农业大学肉鸡双向选择品系(NEAUHLF)为研究材料,通过关联分析和电子计算分析相结合的方法,研究LEPR外显子功能变异对鸡脂肪沉积的影响。使用5种在线生物信息学工具预测编码区单核苷酸多态性(SNPs)的功能。进一步,通过基于氨基酸残基的保守性和稳定性分析、蛋白质配体结合位点的预测、蛋白质二级结构分析、蛋白质三级结构的建模等生物信息学分析,确定了高置信度SNPs的可能结构与功能。同时,对鸡LEPR基因外显子20个非同义单核苷酸多态性(nsSNPs)与腹脂性状进行了关联分析。5种在线生物信息学工具显示,rs731962924(N867I)和rs13684622(C1002R)是最可能影响鸡腹部脂肪性状的功能性nsSNPs。氨基酸残基稳定性和保守型分析显示,大部分nsSNPs可引起蛋白质稳定性下降,rs731962924(N867I)和rs13684622(C1002R)在进化过程中相对保守。蛋白质结构分析显示rs731962924(N867I)和rs13684622(C1002R)均在可引起LEPR蛋白质结构和功能的显著变化。关联分析显示rs13684622(C1002R)与鸡腹脂重和腹脂率显著相关(P=0.0413,P=0.0260)。因此,我们认为rs13684622(C1002R)可能是一个影响鸡腹脂沉积的重要功能性SNP,有望应用于分子标记辅助选择(MAS)中培育低脂肉鸡品系。本研究的主要创新点是结合了多种生物信息学方法和nsSNPs与腹脂性状之间的关联分析进行LEPR基因功能性SNPs的筛选,为后续进行深入的功能分析提供优先研究SNP(priorization SNP)。此外,本研究用到的关联分析与计算机电子计算分析相结合的方法为鉴定农业动物重要经济性状的功能性分子标记提供了一条新的途径。

Cite this article:

LI Yu-dong, WANG Wei-jia, LI Zi-wei, WANG Ning, XIAO Fan, GAO Hai-he, GUO Huai-shun, LI Hui, WANG Shou-zhi. 2021. Integration of association and computational methods reveals functional variants of LEPR gene for abdominal fat content in chickens. Journal of Integrative Agriculture, 20(10): 2734–2748..

UBE2I stimulates female gonadal differentiation in chicken (Gallus gallus) embryos

雌性特异表达基因UBE2I参与鸡性别分化

该研究报道了一个新的雌性特异表达基因UBE2I,鉴定了其在鸡两性组织器官中的表达模式,并通过体内实验(干扰和过表达)研究了UBE2I在鸡胚性腺发育中的生物学功能。研究发现,UBE2I在鸡早期胚胎性腺中的PGCs(原始生殖细胞)中高表达,并在新生鸡卵巢组织中表现出高表达。与此同时,研究团队结合慢病毒和鸡胚血管注射技术建立了在鸡胚体内长期稳定干扰或过表达UBE2I表达的有效方法,并发现在UBE2I过表达的情况下,雌性的性别相关基因(FOXL2CYP19A1HINTW)被上调,而雄性的性别相关基因(SOX9DMRT1WT1)在干扰UBE2I后被下调,其对应的鸡胚性腺的组织也出现了对应的结构变化。与此同时,UBE2I表达的变化与雌二醇及其受体(ARESR)的水平有关,这些结果表明UBE2I是启动雌性鸡胚卵巢发育的关键因素。该研究结果有力的证明了UBE2I在鸡胚胎性别发育和分化过程中发挥了关键的作用。这是第一次报道UBE2I基因在鸡胚性别分化过程中发挥的功能,而UBE2I作为泛素化修饰过程中的重要调控因子,为进一步研究家禽性别决定的分子机理提供了新的思路。

Cite this article:

JIN Kai, ZHOU Jing, ZUO Qi-sheng, LI Jian-cheng, Jiuzhou SONG, ZHANG Ya-ni, CHANG Guo-bing, CHEN Guo-hong, LI Bi-chun. 2021. UBE2I stimulates female gonadal differentiation in chicken (Gallus gallus) embryos. Journal of Integrative Agriculture, 20(11): 2986–2994.

Expression and contribution of microphthalmia-associated transcription factor to the melanin deposition in Liancheng white ducks

连城白鸭小眼畸形相关转录因子的组织表达及其与黑色素沉积的关系

本研究以连城白鸭母鸭为研究对象,利用巢式PCR方法从连城白鸭皮肤组织中克隆到其MITF基因序列,采用实时荧光定量PCR方法对连城白鸭各组织MITF基因的mRNA相对表达量进行分析;并利用紫外分光光度法测定连城白鸭各组织黑色素的沉积量,应用线性相关分析方法分析连城白鸭各组织MITF基因的mRNA表达量与黑色素沉积的相关性。结果表明,连城白鸭MITF基因长度为1323bp (登录号:MG516570),该序列包含一个完整的CDS区(34-1323bp),编码429个氨基酸;其和绿头鸭的氨基酸同源性为100%,与原鸡、鹌鹑等鸟类的氨基酸同源性在95%以上;遗传进化分析发现,连城白鸭MITF与绿头鸭的亲缘关系最近,与鸿雁、白绒乌鸡、原鸡等亲缘关系次之,与猪、绵羊等哺乳动物的亲缘关系最远。实时荧光定量PCR分析发现,MITF基因mRNA表达量以连城白鸭皮肤组织最高,极显著高于其它各组织(P<0.01);各组织依次为:皮肤>肾脏>肌胃>肝脏>肌肉。紫外分光光度计检测结果显示连城白鸭各组织黑色素的沉积规律与各组织MITF基因的表达量基本一致;连城白鸭5个组织MITF基因表达量与黑色素含量呈显著正相关(P<0.05)。结果表明,MITF基因在连城白鸭组织中的表达具有组织特异性,对连城白鸭各组织体内黑色素的沉积起到正向调控作用,MITF基因的高表达有利于连城白鸭体内黑色素的生成。目前关于连城白鸭MITF基因mRNA相对表达水平与连城白鸭组织黑色素沉积的影响尚未见相关报道。因此,本研究率先通过克隆连城白鸭MITF基因序列,并测定连城白鸭不同组织MITF基因的mRNA表达及黑色素的沉积差异,分析MITF基因表达与黑色素沉积的相关性。

Cite this article:

XIN Qing-wu, MIAO Zhong-wei, LIU Zhao-yuan, LI Li, ZHANG Lin-li, ZHU Zhi-ming, ZHANG Zheng-hong, ZHENG Nen-zhu, WANG Zheng-chao. 2020. Expression and contribution of microphthalmia-associated transcription factor to the melanin deposition in Liancheng white ducks. Journal of Integrative Agriculture, 19(3): 800–809.

Investigating structural impact of a valine to isoleucine substitution on anti-Müllerian hormone in silico and genetic association of the variant and AMH expression with egg production in chickens

AMH基因错义突变Val566Ile的结构性影响及Val566Ile和AMH表达与鸡产蛋性状的关联性

本研究旨在阐明AMH基因内错义突变(Val566Ile)对蛋白结构的影响及其与鸡产蛋性能的关联性;AMH表达与产蛋性能的联系。用同源建模法构建第566位氨基酸为Val和Ile状态下的蛋白三级结构,分析Val566Ile的结构性影响;在216个全同胞家系内测定362只略阳乌鸡31、35和40周龄产蛋数,用数量性状传递不平衡模型检验Val566Ile与产蛋数的关联性;检测AMH在略阳乌鸡(低产蛋性能,n=6)和尼克蛋鸡(高产蛋性能,n=6)层级前卵泡颗粒细胞中的表达量,分析AMH表达与产蛋性能的关系。Val566在哺乳动物和鸟类中不保守,但其疏水属性完全保守。Val566突变为Ile566会影响22个氨基酸残基的氢键和溶剂可及性,并在C端创建一个短的α螺旋。尽管有着明显的结构性效应,但Val566Ile在略阳乌鸡群体中与31、35和40周龄产蛋数的关联性并未得到统计学证据的支持(P>0.05)。AMH在略阳乌鸡和尼克蛋鸡间的表达量也无显著差异(P>0.05)。这些结果支持Val566Ile是一个影响AMH蛋白结构的错义突变,但不是调控略阳乌鸡产蛋性能的关键突变。AMH是否通过表达量变化影响鸡产蛋性能与品种遗传背景有关。

Cite this article:

DANG Li-ping, LIU Rui-fang, ZHAO Wen-yan, ZHOU Wen-xin, MIN Yu-na, WANG Zhe-peng. 2020. Investigating structural impact of a valine to isoleucine substitution on anti-Müllerian hormone in silico and genetic association of the variant and AMH expression with egg production in chickens. Journal of Integrative Agriculture, 19(6): 1635–1643.

PGC-1α differentially regulates the mRNA expression profiles of genes related to myofiber type specificity in chicken

PGC-1α差异性调节鸡肌纤维类型特异性相关基因mRNA表达谱

本研究在鸡原代成肌细胞中通过慢病毒介导PGC-1α基因过表达或沉默表达,用实时荧光定量PCR法和Western blotting实验验证PGC-1α基因过表达或沈默表达的效果后,用实时荧光定量PCR法检测肌纤维形成过程中PGC-1α基因过表达或沉默表达对肌纤维类型特异性相关基因mRNA表达的影响。实时荧光定量PCR法和Western blotting实验结果均表明,通过慢病毒成功在鸡原代成肌细胞中过表达或沈默表达PGC-1α基因,从增殖到分化,PGC-1α基因在鸡成肌细胞中的过表达促进Pax7MyoDCnA基因的表达显著(P<0.01)上调,即与绿色荧光空载体转染组和未转染对照组相比,转染后1天(1I)这些基因表达均开始显著(P<0.01)增加,这种显著性差异(P<0.01)一直持续到转染后9天(1I8D);在PGC-1α基因转染后4天(1I3D)MyoGMEF2cMyHC SM基因表达开始显著(P<0.01)增加,而过表达PGC-1α基因仅在转染后第4天(1I3D)时显著(P<0.01)下调MyHC FWM基因的表达;在肌纤维形成中过表达PGC-1α基因对CnB1NFATc3MyHC FRM基因的表达没有显著影响(P>0.05)。通过慢病毒介导shRNA转染鸡原代成肌细胞,在转染4天(1I3D)后检测到PGC-1α基因mRNA和蛋白沉默表达,PGC-1α基因功能的缺失引起基因Pax7、MyoD、CnAα、MyoG、MEF2cMyHC SM表达的显著下调(P<0.01),基因MyHC FWM表达的显著上调(P<0.01),而对基因CnB1NFATc3MyHC FRM的表达没有显著影响(P>0.01)。这些结果提示,PGC-1α在鸡骨骼肌中的作用可能与哺乳动物相似,即通过与肌细胞分化和钙调磷酸酶信号通路中的关键基因相互作用共同调节肌纤维类型的特异性。

Cite this article:

SHAN Yan-ju, JI Gai-ge, ZOU Jian-min, ZHANG Ming, TU Yun-jie, LIU Yi-fan, JU Xiao-jun, SHU Jing-ting. 2020. PGC-1α differentially regulates the mRNA expression profiles of genes related to myofiber type specificity in chicken. Journal of Integrative Agriculture, 19(8): 2083–2094.

The expression of Lin28B was co-regulated by H3K4me2 and Wnt5a/β-catenin/TCF7L2

H3K4me2和Wnt5a/βcatenin/TCF7L2协同调控Lin28B的表达

本研究克隆了Lin28B的启动子片段并构建pEGFP-pLin28B载体,转染DF-1后有绿色荧光表达;进一步通过染色体步移法克隆不同长度的Lin28B启动子片段并连入PGL3-Basic后转染DF-1细胞,双荧光素酶报告系统检测结果发现-1431bp~-1034bp为Lin28B启动子的核心区域。生物信息学预测发现在该区域存在转录因子TCF7L2的结合位点,突变-1431bp~-1034bp区域的TCF7L2结合位点后,Lin28B的启动活性发生显著的下调。进一步的检测结果表明Wnt信号的激活与抑制能够影响Lin28B的启动子活性,CHIP-qPCR检测结果显示βcatenin-TCF7L2能够富集在Lin28B启动子的核心区域。体内外激活或抑制Wnt信号后,Lin28B的表达会发生显著上调或下调;同时,H3K4me2能够富集在Lin28B启动子区域,并通过影响Lin28B对Wnt信号的应答的方式来调节其活性。本研究结果表明H3K4me2和Wnt5a/βcatenin/TCF7L2信号是调节Lin28B表达的两个正向调控因子,将为阐明Lin28B的表达调控机理奠定理论基础。

Cite this article:

ZHANG Ya-ni, HU Cai, WANG Ying-jie, ZUO Qi-sheng, LI Bi-chun. 2020. The expression of Lin28B was co-regulated by H3K4me2 and Wnt5a/β-catenin/TCF7L2. Journal of Integrative Agriculture, 19(12): 3054–3064.

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